第41章~第50章註釋
第41章：
基隆港東北方向的三座島嶼分別名為社寮島、桶盤嶼、中山仔島，後世經填海連成一片，即為如今的和平島。
第42章：
1、“蟒甲長三十餘尺，中廣約八尺，深半之，只一大木而剖其中，毫無增益，古制也，舟之始也。”——出自曹士桂《宦海日記》，作者在道光年間曾於北台灣任職。“蟒甲”即巴賽語獨木舟之意，今之地名“艋舺”亦為此詞音譯。
2、“衣名‘幾轆’，長至腰，毗布及達戈紋為之。下體圍布二幅，亦名‘遮陰’，間有衣鹿皮者。”——出自《續修台灣府志》
3、“又男番喜穿耳，納竹圈於中，漸易大者。久之，將垂及肩，乃實以圓木或嵌螺錢，各縣社番多有之。”——出自《清職貢選圖》
4、“發在周圍者悉除之，中留圓頂，剪而下垂，狀如頭陀。”——出自《諸羅縣誌》。這種髮型在北台灣原住民中很普遍，西部平原上也有束髮或包頭的。
5、“若夫平地近番，女擇其所愛者，乃與挽手，挽手者以明私許之意也。明日，女告其父母，召挽手少年至，鑿上顎門牙旁二齒授女，女亦盤二齒付男，期某日就婦室婚。”——出自郁永河《裨海紀游》。
6、關於基隆港的金包里社和大雞籠社這兩個貿易村社，西班牙史料里有記載。現在的新北市有一條金包里老街，這是清代金包里社的社址，應該是西班牙人侵佔基隆后遷徙至此。據西班牙人記載，金包里社和大雞籠社給他們留下了一千多座空屋子。
第43章：
“淡水地潮濕，番人作室，結草構成，為梯以入，鋪木板於地，亦用木板為屋，如覆舟。”——出自《番俗六考》
第44章：
基隆金包里社源出於淡水沙巴里社來自西班牙人的記載，后收錄於《淡水鎮志》。
第45章：
1、“誥敕勘合及印信番本，逐一查驗明白，果無冒偽影射情弊，方許具本起送。各番地方遠近不齊，貢期不必拘以三年，但未及三年不許來貢，不願者不強。”——出自《大明會典》卷一百八朝貢通例。
2、雙嶼即今舟山六橫島，烈港即今舟山金塘島西北部的瀝港。文中所言李旦、許心素為李光頭、許棟後代，包括前文所言李旦被歐華宇所救均為小說虛構，並無史料支撐，但李、歐、許確為結義兄弟，在此一併說明。
3、嘉靖大倭寇雖然有不少是中國人，但其中的軍事骨幹基本都是日本人，經過正規軍事訓練，比如大友義鎮的水軍就直接參与了好幾場戰爭，詳見《明代倭寇史略》。直到隆萬年間，大海盜林鳳手下負責軍事指揮的仍然是名為庄公的日本人。
第46章：
明代廈門島上的駐軍除了隸屬於福建都司永寧衛的中左所外，尚有鎮戍制營兵。其沿革如下：
景泰三年，浯嶼水寨內遷至廈門，統兵將領為欽依把總。萬曆三十年再遷於晉江石獅；
隆慶四年，在廈門設立浯銅游兵，統兵將領為名色把總；
萬曆二十年，福建南路副總兵（原為守備，后改參將，嘉靖四十三年改副總兵）移駐廈門，統領標下三營（均為名色把總）、浯嶼水寨、銅山水寨（欽依把總）、浯銅游兵，以及漳泉二府的海防衛所和巡檢司；
天啟二年因紅夷犯境，在廈門設立泉南遊擊，下轄浯嶼水寨、浯銅游兵。福建南路副總兵回駐銅山，仍轄標下三營、銅山水寨，聽漳潮副總兵（駐地在廣東潮州南澳島）節制。
第47章：
“許心素為鄭弁所殺，向傳以為真也。職蒙台台委查，即訊之鄭弁，語多兩岐，則殺似未真。本府行票着伊家屬跟要。而素之次男一龍，斃於獄矣。長男樂天，還竄久矣。”——出自《靖海紀略》，作者曹履泰曾在同安任知縣五年（廈門當時屬同安縣）。該書主要由曹履泰在同安任上的公文整理而成，這一條是他在崇禎三年給時任福建右布政使陸之祺的信件。
第48章：
1、“海上之戰無他術，大船勝小船，大銃勝小銃，多船勝寡船，多銃勝寡銃而已。”——出自俞大猷《正氣堂集》
2、“馭兵無體，專以送禮厚薄為禮貌……不習波濤，登舟即時吐浪，是以一切船務不能查理……但聞警報一味畏縮”——出自朱一馮《為循例舉劾澎湖守備游擊王夢熊等員事》，收錄於《明清台灣史料彙編》。以上均說的是時任浯銅游兵把總方獻可。
3、李旦忽悠英國人的始末記載在柯克斯的日記中，該日記後來被整理成《平戶英國商館日記》，於上世紀五十年代出版。
4、李旦忽悠荷蘭人及打劫前往大員船隻的事見《荷蘭聯合東印度公司台灣長官致巴達維亞總督書信集》，該書於本世紀由台灣學者江樹生等人整理翻譯出版。
5、“彭湖既復，海甸方清，而夷倭交通，尚伏近島，謹陳用間方略，以靖餘孽，以永奠南陲”——出自《兵部題行條陳彭湖善後事宜殘稿》。
第49章：
“芝龍不追、不殺、不焚、不掠，似有歸命之意。”——出自《靖海錄》
“今龍之為賊，又與祿異。假仁假義，所到地方，但令報水，而未嘗殺人。有徹貧者，且以錢米與之。其行事更為可慮耳。”——出自《靖海紀略》
第50章：
1.兩萬金指的是二萬兩白銀，而非二萬兩黃金。
2.“海道一員，駐紮寧波，巡海、兼理寧紹兵備，經營沿海衛所，管理水陸兵糧。”——出自《大明會典》李東陽撰，申時行重修。
3.“浙江按察司僉事洪承疇為本省布政使司右參議寧紹兵備道。”——出自《明熹宗實錄》，洪承疇於天啟二年四月出任寧紹兵備道兼浙江海道，天啟六年二月前後離任。