第1章 旗木卡卡西
火影世界，第三次忍界大戰，霧忍村與木葉忍村的一處戰場。
血，全部都是血，陰冷地面上的鮮血已經流成了一條小河，而自己就躺在這一條鮮血融匯的河流之中。外部的衣衫、內部的肌膚、乃至抬起來的雙手都沾滿了血腥。突兀，超越神經承受極限的痛楚從靈魂深處湧現：“啊！！！”
在外人看來，剛剛從血泊中爬起的銀髮少年，發出了野獸般歇斯底里的怒吼，便再度重重摔倒在血泊之中：是生命不能承受之痛？是因為無法接受自己殺死摯友的事實…然而並沒有人知道，究竟發生了什麼。
來人了，而且是不在少數：“在這裏！”
有掌心散發藍綠色光芒的女性忍者，準備對昏迷不醒的少年進行醫治。只是少年體表突然浮現“噼里啪啦”的好一陣金色電流強光，驚得醫療女忍者連連後退：“這是？”
…
一個活着，但是早已死去；一個死去，卻是最終重活。不知過了多久，終於接融合了少年的全部，包括身體、包括記憶。從某種意義上來講，男子再度的復活不假，但他與之前的兩段人生已然再無瓜葛：“我，就是旗木卡卡西：金色閃光波風水門的弟子、木葉白牙旗木朔茂之子，旗木家族最後的男人！”
當有了這種明悟之後，卡卡西終是從沉睡中醒來…這裏，原來是火影忍者的世界么？
木葉四十七年，第三次忍界大戰已經到了最後的尾聲階段。最強大的火之國木葉忍村幾乎以一己之力直面忍界其它四大忍村的挑戰：
風之國的砂忍村，因為三代目風影的失蹤，砂忍村面臨內亂局面，急需要一場戰爭來釋放忍村積蓄日久的仇恨。也就是這個時間，野心勃勃的土之國岩忍村發出了合作的信號。於是，風之國悍然入侵火之國邊境區域，在火之國邊境桔梗山發生戰爭。結果：風之國戰敗，被俘無算！
土之國的岩忍村，第三次忍界大戰的絕對主力。木葉白牙不光彩自殺身死、木葉三忍或出走或退居二線。此刻，能夠力挽戰爭於狂瀾的唯有被冠上金色閃光稱號波風水門一人而已。而波風水門也沒有讓世人失望，第三次忍界大戰的戰爭第一法則：如碰上金色閃光，可自行放棄任務，不受處罰！
波風水門牽扯了土之國絕大部分的主力，旗木卡卡西小隊負責突襲岩忍村的後方補給要道神無毗橋。神無毗橋一役，水門班失去了宇智波帶土這個重要成員；神無毗一役，木葉多了倆個寫輪眼英雄：死去的宇智波帶土、活着的旗木卡卡西。
雷之國的雲忍村，第三次忍界大戰唯一損失掉本國影的忍村。第三代雷影，號稱歷代雷影最強，擁有最強之矛、最強之盾。土之國尋求打開木葉這個缺口不成，立即轉而偷襲雲忍村，這是一場遭遇戰：以上萬忍者的性命，只為用絕對的數量來堆死一人，他就是雲忍村第三代雷影。
雲忍村算盤打得很好，以第三代雷影坐鎮與土之國邊境。在木葉與砂忍村、岩忍村接連大戰過後，派出雷影之子以及八尾人柱力比兩大影級戰力，欲要一口吃成一個胖子。最終：前線，雲忍村的AB組合碰上了木葉的金色閃光，止步不前；後方，雲忍村被岩忍村突襲，三代目雷影為掩護隊友大戰三天三夜，力竭而死！
這個時候，唯一沒有徹底參戰的五大忍村，就只剩下一個施行鎖國外交策略的霧忍村。木葉，從忍村初立，就是屹立於整個忍界的最強忍村：最優的環境、最好的資源、最強的忍者。如今的木葉，看起來是四十七年以來最風雨飄搖之時，霧忍村怎麼可能不蠢蠢欲動。
於是，旗木卡卡西所經歷人生最慘烈的一幕發生了，他親手殺死了自己的同伴，琳：那個總是牽着自己與帶土兩個人，那個什麼時候都一臉笑容的明麗少女。
一如木葉擁有最強尾獸九尾，雲忍村擁有八尾、二尾，砂忍村擁有一尾，岩忍村擁有四尾、五尾，而霧忍村則是擁有三尾、六尾。此時木葉有如日中天的飛雷神金色閃光，砂忍村、岩忍村、雲忍村已經用自己失敗，證明了一件事兒，那就是正面戰爭不可能打贏有波風水門出現的戰役。除非，除非以木葉的忍者來進攻木葉…
琳，作為波風水門的弟子，被霧忍村選為了進攻木葉的最好棋子。霧忍村不惜將本村的三尾封印在琳的體內，設置好一個陷阱等待木葉的忍者來上鉤：卡卡西來了，為救琳而來，這一切都在霧忍村的預料之內。霧忍村的大批忍者明明可以在一瞬間就淹沒卡卡西與琳的身影，但他們卻偏偏不急不緩、似乎有意驅趕卡卡西兩人向著木葉方向進發。
琳，是清醒地，她清楚的知道霧忍村對自己做了什麼。然而被下了咒印的她，不可以告訴卡卡西事實，也不可以選擇自我了斷。眼看火之國邊境越來越近，琳作出了自己的選擇，她願意死在卡卡西的千鳥之下，這也是少女最後一次的笑顏，且一如往昔：“卡卡西…”
…
就這樣，水門班名存實亡。宇智波帶土，身隕於神無毗一役；而琳，則是死在霧忍村的陰謀之下。而作為水門班的最後一個成員，旗木卡卡西，本質上也不再是那麼純粹。新生之後的旗木卡卡西，出院了。一睡就是三天，但他的身體狀態卻是前所未有的好，連最經驗豐富的醫療忍者都找不出任何的問題。
唯一的隱秘，是關於卡卡西在戰場暈倒之時，渾身散發出的透體金色閃電。有關這點，木葉高層已經是下了封口令。卡卡西在木葉醫院昏迷期間，身為現任火影的猿飛日斬曾前來察看，並無發現什麼異樣。只是臨走時候重重地嘆息一聲，在這位火影老頭子看來：卡卡西是哀莫大於心死，明明身體、精神都沒有什麼問題，不願醒來…也唯有這個解釋。
旗木家族駐地，如今只屬於卡卡西一人，他就是旗木家族當之無愧的族長。依舊保持生人勿近的冷麵，卡卡西現在可以好好思索一些事情了，有關火影忍者這個真實世界：
第一世記憶，定格在一個藍星世界的2011年。卡卡西清楚記着，當時的火影動畫出到四百集出頭。身為藍星最頂尖的殺手之一，沒什麼特別的愛好，就是喜歡那些真實的世界，殘酷的世界…而火影，恰好有那麼一丁點味道兒，比如人心人性、再比如冷血暗殺。
第二世記憶很短暫，只持續了一年左右而已。相較於火影的隱晦，第一世自己潛意識中或許更親睞這個真正惡意滿滿的世界。正因為如此，第二世才會蘇醒在那個世界吧。自己也確實做到了…若不然，也不會出現第三世，而這一世或許也將成為自己的最後一世人生。
不存在了，卡卡西清楚的記着：自己在藍星世界時，以驚天手段、身死魂消為代價搶奪到手的某疑似穿越者遺物。那是西漢絕無僅有的一位牛人，他的墓葬中出土了一件超現代工藝手套。原本應該鑲嵌有五顆寶石的，而卡卡西第一次見到的時候，只剩餘兩顆。
第二世蘇醒后，手套依然在卡卡西的左手，只不過寶石的數量只剩下最後孤零零一顆。當時，卡卡西就有所明悟，再一次這種類似的經歷，這件奇物就將徹底失去它的效用。同時，卡卡西也明白了，那位西漢先行者前輩遺留的碑文：再不來了，扯淡，一點都不好玩！
不過，卡卡西可不會輕易相信這種早已作古前輩的鬼話。什麼再不來了，是根本無法再來才對。卡卡西有足夠的理由懷疑，那一位前輩去錯了地方、或者說去錯了時間。西漢末年，世間已不存在再度啟動手套的超自然能量。
卡卡西的推論並不是無的放矢，自己第一次的啟動手套，是因為在某中部國家被一發小當量正中；而自己第二次啟動手套，則是因為自己得到了第二世那個世界最強悍、也是最無解的究極力量。在某種意義上，其已經超越了凡俗的界限。
這次蘇醒，再沒有見到手套的蹤影。卡卡西對此，早已經有了心理準備：“火影世界嘛，正合吾意！”